DNA 链错位反应的设计
生物大分子
2025-10-13 v1 分子网络
摘要
DNA 链错位 (SD) 反应是许多合成核酸系统运行的核心环节，包括分子电路、传感器和机器人。多年来，已涌现出多套设计框架，以适应各种功能目标、初始配置和环境条件。尽管如此，关键挑战仍然存在，尤其是可靠预测反应动力学方面。本综述检视了近期的 SD 反应设计方法，重点考察单一反应的性质，包括动力学、结构因素以及当前建模实践中的局限性。我们指出了具有前景的创新，同时分析了持续阻碍预测准确性的因素。我们指出，未来实现 DNA 基系统中更稳健、可编程行为的方向。
引用
@article{arxiv.2510.09372,
title = {Design of DNA Strand Displacement Reactions},
author = {Križan Jurinović and Merry Mitra and Rakesh Mukherjee and Thomas E. Ouldridge},
journal= {arXiv preprint arXiv:2510.09372},
year = {2025}
}
备注
16 pages, 3 figures. Invited review article