人类21号染色体中结构相关DNA序列特征的大尺度振荡
基因组学
2007-05-23 v1
摘要
人类21号染色体是人类基因组中唯一表现出周期长度为数百千碱基（靠近右端粒处为500 kb）的(G+C)含量振荡的染色体。我们旨在确立结构相关序列特征中存在类似周期性，以便将该(G+C)%振荡与其他生物学现象相联系。以下量被证明在人类21号染色体中以相同的500 kb周期性振荡：由两套基于二核苷酸的热力学参数计算的结合能、AA/TT与AAA/TTT二/三核苷酸密度、5'-TA-3'二核苷酸密度，以及AA/TT或AAA/TTT的10/11碱基周期性的信号。这些内禀量与DNA分子双螺旋的结构特征相关，例如碱基对结合、解旋/解绕、刚度，以及一种假定的核小体形成倾向。
引用
@article{arxiv.q-bio/0606016,
title = {Large-scale Oscillation of Structure-Related DNA Sequence Features in Human Chromosome 21},
author = {Wentian Li and Pedro Miramontes},
journal= {arXiv preprint arXiv:q-bio/0606016},
year = {2007}
}
备注
submitted to Physical Review E