人类基因组序列的核苷酸含量、基因结构与基因表达特征之间的关系(博士论文摘要)
基因组学
2011-01-04 v1
摘要
本论文专注于研究人类基因组中功能元件与其核苷酸结构之间的关联。核苷酸含量的不对称性(偏斜、偏差)被选为核苷酸结构的主要特征。发现人类外显子与内含子在核苷酸含量不对称性上存在显著差异。具体而言,外显子序列表现出对嘌呤的偏好(即 A 和 G 过量于 C 和 T),而内含子则表现出酮-氨基偏斜(即 G 和 T 过量于 A 和 C)。这些偏斜的程度取决于基因表达模式。最高的内含子酮-氨基偏斜出现在看家基因的内含子中。对于序列处于弱修复系统下的内含子,AT->GC 和 CG->TA 替换优先积累。对编码人类及代表性哺乳动物细胞色素 P450 2E1 的基因序列进行了比较分析。基于基因 Cyp2e1 编码序列相似性构建了分支树。开发了新的 NCBI 数据库序列挖掘与分析编程工具,并由此构建了一个自有数据库。
引用
@article{arxiv.1101.0100,
title = {Relationships among the nucleotide content of human genome sequence, gene structure, and gene expression features (PhD synopsis)},
author = {Diana Duplij},
journal= {arXiv preprint arXiv:1101.0100},
year = {2011}
}
备注
21 pages, 9 figures, 3 table, avtoreferat (synopsis) of Dissertation (PhD Thesis) to attain the rank of the Candidate (PhD) of Biological Sciences by speciality 03.00.03, Molecular Biology, Institute of Molecular Biology and Genetics of Ukrainian National Academy of Sciences, Kyiv, 2010