中文

删除信道下种群恢复问题的改进算法

数据结构与算法 2020-11-05 v2

摘要

种群恢复问题要求给定从未知分布中抽取的独立含噪字符串样本,恢复该分布于 nn 位字符串上的未知分布。近期,Ban 等人 [BCF+19] 研究了噪声由删除信道引起的该问题。此问题推广了著名的迹重建问题,后者旨在删除信道下学习单个字符串。Ban 等人展示了如何使用 exp(n1/2(logn)O())\exp\big(n^{1/2} \cdot (\log n)^{O(\ell)}\big) 个样本学习字符串上的 \ell-稀疏分布。本工作中,我们通过发展 [DOS17, NP17] 算法的矩高阶类比(该算法以 exp(O~(n1/3))\exp\big(\tilde{O}(n^{1/3})\big) 样本解决迹重建),仅用 exp(O~(n1/3)2)\exp\big(\tilde{O}(n^{1/3}) \cdot \ell^2\big) 个样本学习该分布。我们还给出了首个运行时间在 nn 上亚指数的算法,以 exp(O~(n1/3)3)\exp\big(\tilde{O}(n^{1/3}) \cdot \ell^3\big) 样本与时间解决种群恢复。值得注意的是,当 =O(1)\ell = O(1) 时,我们对 nn 的依赖几乎匹配 [DOS17, NP17] 的上界,且我们将对 \ell 的依赖从双指数降为单指数。因此,我们能够学习大规模字符串混合:Ban 等人的算法仅能以亚指数样本量学习 O(logn/loglogn)O(\log n/\log \log n) 个字符串的混合,而我们能以 exp(n1/3+o(1))\exp\big(n^{1/3 + o(1)}\big) 样本与时间学习 no(1)n^{o(1)} 个字符串的混合。

关键词

引用

@article{arxiv.2004.06828,
  title  = {Improved Algorithms for Population Recovery from the Deletion Channel},
  author = {Shyam Narayanan},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2004.06828},
  year   = {2020}
}

备注

30 pages. To appear in Symposium on Discrete Algorithms (SODA), 2021