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理想的、最佳堆积的与能量最小化的双螺旋

计算物理 2016-03-21 v2 微分几何 定量方法

摘要

我们使用三种泛函通过计算方法研究具有直轴的最优双螺旋(或其周围最粗的管):使用绳长的理想双螺旋、最佳体积堆积双螺旋,以及使用两股链之间rαr^{-\alpha}1rexp(kr)\frac{1}{r}\exp(-kr)两类单参数族相互作用能的能量最小化双螺旋。我们将数值结果与DNA的实验数据进行了比较。

关键词

引用

@article{arxiv.1104.0489,
  title  = {Ideal, best packing, and energy minimizing double helices},
  author = {Jun O'Hara},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1104.0489},
  year   = {2016}
}

备注

10 pages, 16 figures, to appear in Progress of Theoretical Physics Supplement. Minor change and reference updated