对氟苯酚的水合动力学与红外光谱
化学物理
2022-06-22 v1
摘要
卤代基团在药物应用中具有重要意义，并可作为红外光谱的潜在有用光谱探针。本工作中，利用实验与分子动力学（MD）模拟相结合的方法，研究了气相和水相中了对氟苯酚（F-PhOH）和苯酚（PhOH）的结构动力学与红外光谱。基于经验能量函数（静电作用采用点电荷或多极矩）、基于机器学习（ML）的参数化，以及全 （QM）和混合量子力学/分子力学（QM/MM）模拟，从原子尺度模拟刻画了 F-PhOH 和 PhOH 周围的气体相与溶剂动力学，特别关注 CF 和 OH 伸缩振动区域。CF 伸缩带与其他模式严重混合，而溶液中的 OH 伸缩显示出约 3600 cm 的特征高频峰，最可能归属于 PhOH 和 F-PhOH 的 -OH 基团，并因与水模式的耦合在 3000 cm 以下呈现特征 progression，这也被多个模拟所复现。溶剂和径向分布函数表明，除使用点电荷的模拟外，CF 位点大体呈疏水性，点电荷模拟因此不适合正确描述氟化位点周围的水合与动力学。
引用
@article{arxiv.2206.10463,
title = {Hydration Dynamics and IR Spectroscopy of 4-Fluorophenol},
author = {Seyedeh Maryam Salehi and Silvan Käser and Kai Töpfer and Polydefkis Diamantis and Rolf Pfister and Peter Hamm and Ursula Röthlisberger and Markus Meuwly},
journal= {arXiv preprint arXiv:2206.10463},
year = {2022}
}
备注
Main Manuscript: 41 pages and 6 figures, SI: 10 pages and 10 figures