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摩擦系数分解以分析水合效应对 C$_{60}$(OH)$_{\rm n}$ 的影响

生物物理 2024-09-26 v1

摘要

为了分析水合效应对大分子扩散的影响,使用全原子模型的分子动力学模拟检查了大分子的摩擦系数。在本研究中,引入了一种将分子摩擦系数分解为大分子上每个位点贡献的方法。该方法应用于环境水中的几种富勒醇。亲水部分(如 OH 基团)的摩擦系数大于疏水部分(如 C)的摩擦系数。水合效应不仅取决于官能团的种类,还取决于表面粗糙度。这种方法将有助于解释实验观察到的蛋白质扩散系数随构象变化而发生的大幅变化。

关键词

引用

@article{arxiv.2409.17028,
  title  = {Decomposition of Friction Coefficients to Analyze Hydration Effects on a C$_{60}$(OH)$_{\rm n}$},
  author = {Tomoya Iwashita and Yuki Uematsu and Masahide Terazima and Ryo Akiyama},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2409.17028},
  year   = {2024}
}

备注

34 pages, 14 figures