广义Voronoi镶嵌作为二维细胞组织动力学模型
生物物理
2009-12-02 v2 计算物理
组织与器官
摘要
Voronoi镶嵌已被用于模拟形态发生或癌变组织中细胞的几何排列,但迄今为止仅使用平直超曲面作为细胞-细胞接触边界。为了再现实验观察到的分段球形边界形状,我们建立了一个一致的乘性加权距离函数理论框架,定义了围绕不同半径细胞体的广义有限Voronoi邻域,这些细胞体作为生成元,其异质性构成了最终的模型组织。细胞间的相互作用由细胞接触边界上的粘附和排斥力密度表示。此外,在组织边缘的细胞边界上施加了突出运动力,随机扰动则允许非确定性运动效应。对细胞中心位置和速度的随机微分方程系统的模拟表明,这种Voronoi方法能够生成逼真的细胞形状。在单个细胞对短暂接触的极限情况下,我们解析地研究了动态非线性Ornstein-Uhlenbeck过程。总体上,我们观察到拓扑结构不同的组织构型,这些构型在不同时间尺度上表现出稳定性,并通过合适的特征量化了组织相干性。最后,我们推导出一个论点,指出自然组织中细胞大小异质性与细胞片层延伸之间存在权衡关系。
引用
@article{arxiv.0901.4469,
title = {Generalized Voronoi Tessellation as a Model of Two-dimensional Cell Tissue Dynamics},
author = {Martin Bock and Amit Kumar Tyagi and Jan-Ulrich Kreft and Wolfgang Alt},
journal= {arXiv preprint arXiv:0901.4469},
year = {2009}
}
备注
v1: 34 pages, 19 figures v2: reformatted 43 pages, 21 figures, 1 table; minor clarifications, extended supplementary material