含突变设计的杂聚物链的折叠与错误折叠

我们研究了突变（氨基酸序列的改变）对由N个单体组成的简单蛋白质样杂聚物热力学的影响，这些单体代表氨基酸序列。该序列被设计为在立方格子上折叠成其天然构象。我们发现，相当大一部分（介于二分之一到三分之一之间）的替换，我们称之为“冷错误”，对折叠过程的动力学做出了重要贡献，通常使折叠时间增加两倍，而改变的链仍然折叠成天然结构。少数突变（“热错误”）具有相当显著的影响，导致蛋白质错误折叠。我们的分析表明，突变主要影响天然构象的能量学，而对未折叠构象系综的影响要小得多，这证实了“能隙”概念在分析蛋白质样杂聚物折叠性质方面的实用性。