单一类溶剂相分离分子中的原生相与变性相的共存

为了理解蛋白质折叠和变性过程中形成的核， 我们研究了单一异聚合物链在平衡状态下的相分离。 这些分离构象由一组叠加于原生构象上的单体核特征化。 我们通过施加“折叠压力”，即为原生单体-单体接触添加能量奖励，来计算生成相分离。 计算模型揭示了异聚合物系统与更熟悉的气液系统之间在核化过程中的根本差异： 在聚合物系统中，某些核会通过拓扑约束阻碍折叠， 必须部分破坏才能使折叠继续进行。 为说明这一发现， 我们通过尺度论证考察了蛋白质变性动力学在长链极限下的行为。 我们发现由于拓扑约束，临界核大小约为整个链的大小， 因此变性时间按 $\exp [c N^{2/3} ]$ 形式增长，其中 $N$ 和 $c$ 分别为链长和常数。