天然无折叠蛋白的数量与基因组大小成比例
基因组学
2008-07-14 v1 种群与进化
摘要
天然无折叠蛋白以其多肽链大部分区域缺乏明确三级结构的柔性构象集合体形式存在。尽管缺乏稳定构型,它们仍参与重要的细胞过程。在这项工作中,我们使用了三个来自折叠状态的指标,这些指标源于对蛋白质序列的平均堆积和平均接触能的分析,以及来自无序预测器VSL2的分析,并将它们组合成一个共识评分,以识别古菌、细菌和真核生物多个基因组中的天然无折叠蛋白。我们发现预测的天然无折叠蛋白数量与基因组中的蛋白质数量之间存在高度相关性。更具体地说,天然无折叠蛋白的数量与基因组中的蛋白质数量成比例,指数为1.81 ± 0.10。这一标度律可能对于理解天然无折叠蛋白数量与其在细胞过程中作用之间的关系具有重要意义。
引用
@article{arxiv.0807.1869,
title = {Number of natively unfolded proteins scales with genome size},
author = {Antonio Deiana and Andrea Giansanti},
journal= {arXiv preprint arXiv:0807.1869},
year = {2008}
}
备注
Submitted to Biophysics and Bioengineering Letters http://padis2.uniroma1.it:81/ojs/index.php/CISB-BBL