蛋白质家族系统发育的标度性质

进化生物学中的一个经典问题是进化过程如何在基因和物种水平上耦合。基于这一动机，我们比较了一大组蛋白质系统发育树与一组物种系统发育树的拓扑性质（主要是深度标度，作为平衡性的表征）。比较分析表明，这两组系统发育树具有显著相似的标度行为，这表明分支规则以及驱动从基因到物种水平的生物多样化的进化过程具有普遍性。为了解释这种普遍性，我们提出了一个简单模型，该模型使我们能够估计逼近系统发育树中观察到的标度行为所需的可进化性/稳健性比例，突出了生物系统（物种或蛋白质）的稳健性在系统发育树标度性质中的相关性。因此，支配生物系统无法多样化的规则在基因和物种水平上同样相关。