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若干DNA序列动力学的遍历性

概率论 2020-03-17 v3

摘要

我们通过叠加两种动力学在整数格点构型上(取值于某个有限字母表)定义相互作用粒子系统:一种具有有限范围速率的替换过程,以及一种可能具有无界范围的循环置换机制(称为“剪切-粘贴”)。该模型受DNA序列动力学的启发:我们考虑一个用于替换的遍历模型,即RN+YpR模型([BGP08]),及其三个特例:JC+cpg、T92+cpg和RNc+YpR模型。我们研究在附加建模核苷酸插入与删除的剪切-粘贴机制后,它们是否仍保持遍历性。利用对偶性或吸引性技术,我们给出了仅关于替换速率的、用于叠加过程遍历性的多组充分条件。它们蕴含了JC+cpg、T92+cpg以及吸引性的RNc+YpR模型在附加剪切-粘贴机制下的遍历性。

关键词

引用

@article{arxiv.1903.06455,
  title  = {Ergodicity of some dynamics of DNA sequences},
  author = {Mikael Falconnet and Nina Gantert and Ellen Saada},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1903.06455},
  year   = {2020}
}