粒子系统的模糊耦合时间及其在依赖上下文的 DNA 替换模型中的应用
概率论
2007-12-04 v1 定量方法
摘要
我们为相互作用粒子系统定义了带有模糊性的耦合时间概念，并展示了如何利用它来证明遍历性，以及界定平衡态的收敛时间和相关性的衰减。其动机是提供简单的条件，以确保受扰动的粒子系统共享底层未扰动系统的某些性质。我们将这些结果应用于分子生物学家最近引入的依赖上下文的替换模型，作为 DNA 进化过程的描述。与大多数假设位点独立进化的常用替换模型不同，这些模型考虑了相邻碱基对 DNA 序列位点替换概率的影响。
引用
@article{arxiv.0712.0072,
title = {Coupling times with ambiguities for particle systems and applications to context-dependent DNA substitution models},
author = {Jean Bérard and Didier Piau},
journal= {arXiv preprint arXiv:0712.0072},
year = {2007}
}
备注
33 pages