配体结合对蛋白质柔性的影响
生物大分子
2015-01-13 v1
摘要
配体在蛋白质上的结合会改变蛋白质某些部分的柔性，这直接影响其功能。这些变化在每一点并不相同，某些部分变得更柔韧，而另一些部分变得更僵硬。本文推导出一个给出蛋白质刚度图的方程。该模型基于需通过分子动力学模拟评估的点对波动相关性。该模型也用高斯网络模型表述，并以AKT1二聚化时刚度的变化作为示例进行了评估。
引用
@article{arxiv.1501.02664,
title = {Effects of ligand binding upon flexibility of proteins},
author = {Burak Erman},
journal= {arXiv preprint arXiv:1501.02664},
year = {2015}
}
备注
6 pages, 3 figures