生物网络的刚性与柔性
生物物理
2012-12-04 v2 无序系统与神经网络
计算工程、金融与科学
计算几何
斑图形成与孤子
分子网络
摘要
在过去十年中,网络方法已成为理解复杂系统行为的广泛使用的工具。我们从结构刚性理论的简要描述开始。详细阐述了蛋白质结构的组合刚性分析,以及蛋白质局部柔性度量及其在解释变构效应和热稳定性方面的应用。我们还简要讨论了细胞骨架张拉整体 (tensegrity) 的网络方面。最后,我们展示了功能柔性与刚性之间的平衡在蛋白质 - 蛋白质相互作用、代谢、基因调控和神经网络中的重要性。我们的总结提出了柔性与刚性概念可以推广到所有网络的可能性。
引用
@article{arxiv.1204.6389,
title = {Rigidity and flexibility of biological networks},
author = {Merse E. Gaspar and Peter Csermely},
journal= {arXiv preprint arXiv:1204.6389},
year = {2012}
}
备注
21 pages, 4 figures, 1 table