干界面与湿界面：溶剂粒子对分子识别的影响
生物物理
2015-05-13 v1
摘要
本文提出了一种粗粒化晶格模型，以研究水对两个刚性蛋白质识别过程的影响。基本模型基于疏水效应构建。随后，我们研究了基本模型的几种修正，表明通过考虑单个溶剂粒子的显式影响，可以提高识别过程的选择性。当蛋白质 - 蛋白质复合物界面处的空腔数量作为内在几何约束固定时，通常存在一个特征填充分数，当水分子填充该分数时选择性达到最大。此外，最佳分数取决于界面的疏水性，因此必须区分干界面和湿界面。
引用
@article{arxiv.0904.2317,
title = {Dry and wet interfaces: Influence of solvent particles on molecular recognition},
author = {Johannes Taktikos and Hans Behringer},
journal= {arXiv preprint arXiv:0904.2317},
year = {2015}
}
备注
11 pages, 7 figures