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疏水相互作用的方向性:对分子识别机制的启示

软凝聚态物质 2021-05-19 v1 化学物理

摘要

基于近期关于疏水相互作用的研究,本文致力于探究疏水相互作用的方向性。这意味着疏水相互作用依赖于相对取向,因为溶质倾向于在水中聚集。在H1w过程中,它们被吸引沿特定方向以较低能垒相互靠近,直至表面接触。在H2s过程中,为最大化水的氢键,溶质沿特定方向聚集以最小化其表面积与体积之比。此外,随着它们之间间距减小,溶质间的短程相互作用增强。另外,这些可通过使用分子动力学模拟计算的势能平均力(PMF)得到证明。从本工作出发,提出了疏水驱动模型以理解水中分子识别的特异性和亲和力。

关键词

引用

@article{arxiv.2011.12389,
  title  = {The directional nature of hydrophobic interactions: Implications for the mechanism of molecular recognition},
  author = {Qiang Sun},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2011.12389},
  year   = {2021}
}