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纳米尺度溶质间疏水与库仑相互作用的竞争

软凝聚态物质 2009-11-10 v1 统计力学

摘要

通过恒温恒压分子动力学模拟,研究了水中带电的纳米级球形溶质的溶剂化,以及两个此类溶质之间有效的、溶剂诱导的力,模拟中使用了携带各种电荷模式的模型溶质。中性溶质的结果与早期发现以及简单宏观考虑的预测非常吻合:显著的疏水吸引力可归因于溶质间溶剂的强烈耗尽(“干燥”)。当溶质均匀带电时,这种疏水吸引力会大大减弱,并且在足够高的电荷下,总力变为排斥力;阴离子和阳离子溶质对之间存在显著的不对称性,后者受到的疏水吸引力较小。当溶质携带离散(而非均匀)的电荷模式时,情况变得更加复杂。由于由此产生的亲水和疏水“斑块”对溶剂分子的拮抗效应,水在溶质周围再次显著耗尽,并且尽管溶质间存在直接的静电排斥,有效相互作用仍恢复为主要吸引。对高度粗粒化的构型概率密度的检查表明,与粗略的隐式溶剂表示的预测相比,在显式溶剂中两个溶质的相对取向非常不同。本研究强烈表明,对球状蛋白质表面电荷分布的真实建模,以及对水的分子处理,是任何可靠的蛋白质聚集研究的必要前提。

关键词

引用

@article{arxiv.cond-mat/0405292,
  title  = {Competition of hydrophobic and Coulombic interactions between nano-sized solutes},
  author = {J. Dzubiella and J. -P. Hansen},
  journal= {arXiv preprint arXiv:cond-mat/0405292},
  year   = {2009}
}

备注

20 pages, 25 figures