方向性是生化网络的固有属性
分子网络
2007-05-23 v2
摘要
反应方向的热力学约束内禀于给定生化网络的结构中。然而,确定大规模代谢网络可行反应方向的具体步骤尚未很好建立。本工作引入一种系统方法,以计算受质量平衡与热力学约束的、基因组规模网络的反应方向。此外,表明受物理化学约束的非凸解空间可由一组线性化子空间近似,其中质量与热力学平衡均得保证。所开发方法可仅基于网络化学计量学,从头预测基因组规模网络的反应方向。
引用
@article{arxiv.q-bio/0701004,
title = {Directionality is an inherent property of biochemical networks},
author = {Feng Yang and Feng Qi and Daniel A. Beard},
journal= {arXiv preprint arXiv:q-bio/0701004},
year = {2007}
}
备注
A short version of the previous one, more concise and previse. It includes 5 pages, 5 figures and 1 table