突变压力、选择压力与氨基酸发生频率之间的相关性
统计力学
2007-05-23 v1 q-bio
摘要
我们发现，氨基酸在生物体中的有效存活时间与其在基因中发生频率之间遵循幂律关系。我们使用突变数据矩阵 PAM1 PET91 来计算每种氨基酸的选择压力。结果与 MPM1 矩阵（代表布鲁氏菌基因组纯突变压力的突变概率矩阵）进行了比较。结果具有普适性，即从更高阶 PAMk 矩阵（k>1）中计算得到的氨基酸存活时间，与 PAM1 矩阵的情况下相同。
引用
@article{arxiv.cond-mat/0301214,
title = {Correlation between mutation pressure, selection pressure and occurrence of amino acids},
author = {A. Nowicka and P. Mackiewicz and M. Dudkiewicz and D. Mackiewicz and M. Kowalczuk and S. Cebrat and M. R. Dudek},
journal= {arXiv preprint arXiv:cond-mat/0301214},
year = {2007}
}
备注
Submitted for The International Conference on Computational Science ICCS'03 (St. Petersburg and Melbourne)