氨基酸分布与最佳生长温度的影响

我们对生物体（特别是极端微生物）在广泛理化条件下生长的基因组统计数据进行了详尽分析。具体而言，我们展示了氨基酸频率与其分子量之间的相关性（平均而言得以保持）如何随着最佳生长温度的升高而典型地降低。我们展示了密码子简并性与氨基酸质量之间的关系如何在这些生物体中被强化。我们评估了连续氨基酸的出现情况，发现了一些显著的短词，通常包含半胱氨酸、组氨酸或脯氨酸。通常，这些词的显著性与生长温度无关。在一种新颖的方法中，首达分布被用于捕捉非连续残基之间的相关性。我们发现了一个近乎普遍的指数背景，并将其与上述单个氨基酸频率的性质联系起来。我们发现这种方法能可靠地提取依赖于生长温度的相关性，其中一些此前尚未被表征。