遗传密码的稳定性与氨基酸的最优参数

众所周知，与具有相同结构（即编码每种特定氨基酸的密码子数量相同）的随机密码相比，标准遗传密码在最小化误读错误和单点突变的不利影响方面效率要高得多。我们研究了逆问题：密码结构如何影响氨基酸的最优理化参数，以确保遗传密码具有最高的稳定性。研究表明，选择两种或多种具有给定性质的氨基酸可以明确地确定所有其他氨基酸。从这个意义上说，密码结构严格决定了氨基酸的最优参数。在具有标准遗传密码结构的密码中，通过“留一法”方案获得的疏水性结果值，以及在固定最大和最小参数的方案中获得的结果值，与自然尺度显著相关。这表明遗传密码与氨基酸的理化性质是协同进化的。