碱基特异性突变与重组速率的调控在遗传密码背景下实现功能适应

生命的持续存在要求种群以与环境动态相适应的速率进行适应。栖息于高度多变环境中的成功种群已进化出提高成功适应可能性的机制。我们引入一个 $64 \times 64$ 矩阵来量化碱基特异性突变潜力，分析了四种不同的复制系统：易错PCR、小鼠抗体、一种线虫和果蝇。突变倾向与蛋白质的结构进化相关。在强选择压力下的系统中，突变偏差被证明有利于适应性搜索空间，无论是通过碱基突变还是重组。这种适应性在遗传密码背景下，在复制和密码子使用层面上进行了讨论。