由软连线簇构建最小系统发育网络是固定参数可解的
计算复杂性
2011-08-19 v1 种群与进化
摘要
这里我们证明，给定分类单元集 X 上的簇集 C，其中 |X|=n，可以在 f(k).poly(n) 时间内确定是否存在一个 level-<= k 网络（即每个双连通分量的网状化数至多为 k 的网络）在软连线意义上表示 C 中的所有簇，如果存在则构建这样一个网络。这扩展了 Kelk、Scornavacca 和 Van Iersel (2011) 在“On the elusiveness of clusters”中的多项式时间结果。通过将“level-k 生成器”的概念推广到一般网络，我们随后将这一固定参数可解性结果扩展到 k 不是指级别而是指整个网络的网状化数的问题。
关键词
引用
@article{arxiv.1108.3653,
title = {Constructing minimal phylogenetic networks from softwired clusters is fixed parameter tractable},
author = {Steven Kelk and Celine Scornavacca},
journal= {arXiv preprint arXiv:1108.3653},
year = {2011}
}
备注
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