Level-k系统发育网络可在多项式时间内由密集三元组集合构建
种群与进化
2009-01-13 v1
摘要
给定一个密集三元组集合，会出现两个有趣的问题：是否存在与一致的某种系统发育网络？如果存在，我们能否找到一种有效的算法来构建一个？对于level 、1或2的网络情况，这些问题已通过有效的多项式算法得到解答。对于更高的level ，最近通过一个针对简单网络的时间算法获得了部分答案。在本文中，我们给出了对一般情况的完整解答。主要思想是利用level-k网络中SN-集的一个特殊性质。作为结果，我们还可以在多项式时间内找到具有最少网状节点数的level-k网络。
引用
@article{arxiv.0901.1657,
title = {Level-k Phylogenetic Network can be Constructed from a Dense Triplet Set in Polynomial Time},
author = {Thu-Hien To and Michel Habib},
journal= {arXiv preprint arXiv:0901.1657},
year = {2009}
}