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基于最优传输与软对齐的时空信号平均方法

机器学习 2022-04-12 v2 机器学习

摘要

从基因组学到神经影像,多个科学领域都需要监测随时间演化的人群(测度)。这些描述兼具时间与空间成分动力学的复杂数据集,给数据分析带来了新的挑战。我们在本工作中提出一个新的框架来对这些数据集进行平均,旨在从多条轨迹中综合出具有代表性的模板轨迹。我们指出这需要处理三种不变性来源:时间、空间以及总人群规模(或质量/幅度)的偏移。在此我们借鉴动态时间规整(DTW)、最优传输(OT)理论及其非平衡扩展(UOT),提出一个能同时应对这三方面问题的准则。该方案利用 DTW 的平滑形式(Soft-DTW)来刻画时间偏移,并利用 UOT 来处理空间与规模上的变化。我们提出的损失函数可用于将时空重心定义为 Fréchet 均值。借助 Fenchel 对偶,我们展示了如何通过一种新颖的熵正则化去偏 UOT 变体,高效、并行地计算这些重心。在手写字母与脑成像数据上的实验证实了我们的理论发现,并说明了所提损失函数在时空数据上的有效性。

关键词

引用

@article{arxiv.2203.05813,
  title  = {Averaging Spatio-temporal Signals using Optimal Transport and Soft Alignments},
  author = {Hicham Janati and Marco Cuturi and Alexandre Gramfort},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2203.05813},
  year   = {2022}
}