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朊病毒AGAAAAGA淀粉样纤维的原子分辨率结构

生物物理 2012-12-14 v1 最优化与控制

摘要

据作者所知,由于淀粉样纤维的不稳定、非结晶和不溶性,关于朊病毒蛋白疏水区(113-120)中AGAAAAGA回文序列的结构数据很少,尽管许多实验研究表明该区域具有淀粉样纤维形成特性,并在朊病毒疾病中发挥重要作用。鉴于此,本研究致力于通过计算方法解决这一问题,这些方法包括局部优化最速下降法、共轭梯度法、离散梯度法和牛顿法、全局优化模拟退火和遗传算法、正则对偶优化理论以及结构生物信息学。本章报道的朊病毒AGAAAAGA淀粉样纤维的最佳原子分辨率结构,对于科学界寻找朊病毒疾病的治疗方法具有价值,或者至少对药物化学的目标有用。

关键词

引用

@article{arxiv.1106.1721,
  title  = {Atomic-resolution structures of prion AGAAAAGA amyloid fibrils},
  author = {Jiapu Zhang},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1106.1721},
  year   = {2012}
}

备注

book Chapter of Amyloids: Composition, Functions and Pathology, NOVA Publishers, 2011