朊病毒AGAAAAGA淀粉样纤维分子建模的优化策略

X射线晶体学和核磁共振(NMR)波谱学是确定蛋白质三维结构的两种强大工具。然而，并非所有蛋白质都能成功结晶，特别是膜蛋白。尽管NMR波谱学在确定膜蛋白三维结构方面确实非常强大，但与X射线晶体学一样，它仍然非常耗时且昂贵。在许多情况下，由于某些蛋白质的非结晶性和不溶性，X射线和NMR根本无法使用。然而，计算方法使我们能够在亚微观水平上获得蛋白质三维结构的描述。据作者所知，迄今为止，关于朊病毒蛋白疏水区(113-120)内的AGAAAAGA回文序列的结构数据很少，该区域恰好位于朊病毒蛋白N端非结构化区(1-123)内。许多实验研究表明，AGAAAAGA区域具有形成淀粉样纤维的特性，并在朊病毒疾病中发挥重要作用。然而，由于淀粉样纤维的非结晶性和不溶性，关于AGAAAAGA的结构数据很少。本文介绍了一种简单的优化策略方法，以解决朊病毒AGAAAAGA淀粉样纤维的原子分辨率三维结构。本文获得的朊病毒AGAAAAGA淀粉样纤维的原子分辨率结构，对于在药物化学领域寻找朊病毒疾病治疗方法具有实用价值。