一种用于朊病毒 AGAAAAGA 淀粉样纤维分子建模的新型对偶计算方法
生物大分子
2013-12-10 v1 计算工程、金融与科学
数学物理
math.MP
最优化与控制
摘要
许多实验研究表明，朊病毒 AGAAAAGA 回文疏水区（113-120）具有形成淀粉样纤维的特性，并在朊病毒疾病中发挥重要作用。然而，由于淀粉样纤维的不稳定、非结晶和不溶性，迄今为止关于 AGAAAAGA 区域（113-120）的结构信息非常有限。该区域恰好位于朊蛋白 N 端非结构化区域 PrP（1-123）内。传统的 X 射线晶体学和核磁共振波谱学实验方法无法获取其结构信息。在此背景下，本文引入了一种基于对偶理论的新方法，以解析朊病毒 AGAAAAGA 淀粉样纤维的三维原子分辨率结构。本文介绍的新型且强大的对偶计算方法用于朊病毒 AGAAAAGA 淀粉样纤维的分子建模，并且本文提出的最优原子分辨率结构有助于在药物化学领域寻找朊病毒疾病的治疗方法。总体而言，本文提出了一种重要方法，并为朊病毒疾病的治疗提供了有用信息。总体而言，本文可能引起理论生物学领域广大读者的兴趣。
引用
@article{arxiv.1107.4104,
title = {A novel canonical dual computational approach for prion AGAAAAGA amyloid fibril molecular modeling},
author = {Jiapu Zhang and David Y. Gao and Johh Yearwood},
journal= {arXiv preprint arXiv:1107.4104},
year = {2013}
}