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野生型兔朊蛋白结构稳定性的分子动力学研究:表面静电电荷分布

生物物理 2012-10-30 v1 生物大分子

摘要

朊病毒病涵盖人类和动物中一大类神经退行性疾病,这些疾病总是致命且具有高度传染性。迄今为止,尚无有效的治疗方法或药物来治疗所有朊病毒病。幸运的是,大量实验经验表明,兔子对从其他物种分离出的朊病毒病感染具有抵抗力,并且最近兔朊蛋白及其突变体的分子结构已发布到蛋白质数据库中。朊病毒病是“蛋白质结构构象”疾病。因此,为了揭示朊病毒病的一些秘密,通过分子结构及其动力学技术研究兔子是合适的。Wen 等人(PLoS One 5(10) e13273 (2010),Journal of Biological Chemistry 285(41) 31682-31693 (2010))报道,NMR RaPrPC(124-228) 分子快照的表面具有一大片连续的正电荷分布区域,这有助于兔朊蛋白的结构稳定性。这只是一个快照下的性质。本文证实,在多种环境下长达 30 纳秒的分子动力学过程中,这一大片正电荷分布区域仍然得以保留,但该区域的连续性并非始终得以保持。这些结果可能对朊病毒病的药物治疗有用。

关键词

引用

@article{arxiv.1109.2238,
  title  = {Molecular Dynamics Studies on the Structural Stability of Wild-Type Rabbit Prion Protein: Surface Electrostatic Charge Distributions},
  author = {Jiapu Zhang},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1109.2238},
  year   = {2012}
}

备注

Invited book-chapter for book: Bioinformatics Research: New Developments (Professor Jean-Michel VERDIER Eds.), Nova Science Publishers, 2011