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朊病毒株竞争的生态-进化权衡动态

种群与进化 2022-07-06 v1

摘要

朊病毒及类朊病毒分子是一类自我复制的聚集蛋白,与多种神经退行性疾病相关。近几十年来,朊病毒的分子动态已通过实证和数学模型得到刻画,增进了对朊病毒疾病流行病学及朊病毒对细胞过程进化影响的理解。同时,大量证据表明朊病毒自身能够进行一种进化:影响其生长或断裂速率的结构变化被复制,使此类变化受到自然选择。本文研究这种选择在以核化聚合模型(NPM)刻画朊病毒特征中的作用。我们表明,断裂速率进化到一个进化稳定值,该值平衡了PrPScPrP^{Sc}聚集体快速复制与产生稳定聚合物的需求。我们进一步表明,该进化出的断裂速率一般不同于优化细胞间传播的速率。我们发现,在NPM下,既进化稳定又针对传播优化的朊病毒具有特征长度3n3n,即其不稳定临界长度的3倍。最后我们研究株间细胞竞争的动态,表明细胞内与细胞间竞争的生态-进化权衡有利于共存。

关键词

引用

@article{arxiv.2207.02014,
  title  = {Eco-evolutionary tradeoffs in the dynamics of prion strain competition},
  author = {Saul Acevedo and Alexander J. Stewart},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2207.02014},
  year   = {2022}
}