一般复制-分化模型下蛋白质-蛋白质相互作用网络的渐近演化
分子网络
2007-05-23 v1 种群与进化
摘要
基因组复制-分化事件是蛋白质新功能的主要来源,其以随机方式发生于从单基因到全基因组的广泛基因组尺度上。显然,这一基本演化过程必然在很大程度上决定了控制众多细胞活动的蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络的新兴结构。我们提出并渐近求解了一个基于复制衍生相互作用的统计选择的PPI网络演化的一般复制-分化模型。我们还引入了一个保守指数,用于形式化定义PPI网络的统计演化保守性。进而表明,微观参数上的不同条件控制着新兴PPI网络的全局保守性与拓扑结构。特别是,保守的、非稠密的网络——也是唯一具有潜在生物学相关性的网络——被证明必然是无标度的。
引用
@article{arxiv.q-bio/0611070,
title = {Asymptotic Evolution of Protein-Protein Interaction Networks for General Duplication-Divergence Models},
author = {Kirill Evlampiev and Herve Isambert},
journal= {arXiv preprint arXiv:q-bio/0611070},
year = {2007}
}
备注
6 pages, 5 figures (+ supporting information: 17 pages 3 figures)