发育中人胚胎中冠状病毒受体及相关因子的单细胞RNA表达图谱
组织与器官
2020-07-27 v2 基因组学
摘要
为预测发育中的人胚胎是否允许冠状病毒感染,我们分析了公开可用的受精卵、4细胞、8细胞、桑葚胚、内细胞团、上胚层、原始内胚层和外胚层滋养层的单细胞RNA-seq数据集,以研究冠状病毒受体(ACE2、BSG、DPP4和ANPEP)、刺突蛋白切割酶(TMPRSS2、CTSL)。我们还分析了参与病毒复制的宿主基因、转运所需的内体分选复合物(ESCRT)以及SARS-Cov-2相互作用的存在情况。结果显示,ACE2、BSG、DPP4和ANPEP在从受精卵到囊胚(包括滋养层谱系)的细胞中均有表达。ACE2、TMPRSS、BSG和CTSL在上胚层的一部分细胞和大多数滋养层细胞中共转录。胚胎和滋养层细胞还表达ESCRT、病毒复制以及那些与SARS-CoV-2相互作用的蛋白基因。我们在上胚层中鉴定出1985个基因、在滋养层中鉴定出1452个基因在ACE2和TMPRSS2共表达细胞中富集;其中216个基因在两种细胞类型中共同存在。这些基因与脂质代谢、溶酶体、过氧化物酶体和氧化磷酸化通路相关。总之,我们的结果表明发育中的人胚胎可能通过经典和非经典机制允许冠状病毒进入,并且它们还表达参与病毒内吞和复制的蛋白基因。该知识将有助于COVID-19大流行期间IVF的循证患者管理。
引用
@article{arxiv.2004.04935,
title = {A single-cell RNA expression map of coronavirus receptors and associated factors in developing human embryos},
author = {Stacy Colaco and Karisma Chhabria and Domdatt Singh and Anshul Bhide and Neha Singh and Abhishek Singh and Atahar Husein and Anuradha Mishra and Richa Sharma and Nancy Ashary and Deepak Modi},
journal= {arXiv preprint arXiv:2004.04935},
year = {2020}
}
备注
33 pages, 6 main figures, 3 main table, 2 supplementary figure