黑腹果蝇胚胎基因转录的随机模型
亚细胞过程
2016-02-10 v1
摘要
我们检查了关于黑腹果蝇( )胚胎上 ()转录本条带2形成的免疫染色实验数据。给出了将免疫荧光强度单位转换为分子数量的因子估计。对条带2区域 mRNA动态的分析表明，基因的启动子位点有两种不同的状态：较早阶段主要被激活直到临界时间变为主要被抑制。这建议提出黑腹果蝇胚胎上基因转录的随机二元模型。我们的模型有两个随机变量：转录本数量以及给定为激活或抑制的mRNA源状态。我们能够重现可用的转录本平均数量的实验数据。给出了 mRNA数量的随机涨落及其对条带2空间精度后果的分析。我们显示前/后边界的位置围绕其平均位置波动约胚胎长度的，这与实验发现相似。这种简单模型对数据的拟合表明它可用于理解发育过程中随机性的功能。
引用
@article{arxiv.1511.03963,
title = {A stochastic model for gene transcription on Drosophila melanogaster embryos},
author = {Guilherme N. Prata and José Eduardo M. Hornos and Alexandre F. Ramos},
journal= {arXiv preprint arXiv:1511.03963},
year = {2016}
}
备注
27 pages, 6 figures in Phys. Rev. E 2015