基于通路的 E. coli 趋化性平均场模型：数学推导与 Keller-Segel 极限
细胞行为
2013-04-29 v2
摘要
最近，文献 [G. Si, T. Wu, Q. Quyang and Y. Tu, Phys. Rev. Lett., 109 (2012), 048101] 提出了一种用于 E. coli 趋化性的基于通路的平均场理论 (PBMFT)。在假设甲基化水平局部集中的前提下，本文利用动理学理论中的矩闭合技术推导了 PBMFT 的一个新的矩系统。该新系统具有带线性对流项的双曲性。在一定假设下，该新系统可以恢复原始模型。特别是，其中所作的关于甲基化差异的假设可以在这个新矩系统中得到明确的解释。通过考虑翻滚、适应和实验观测的不同物理时间尺度，我们得到了 Keller-Segel 极限。我们还提供了数值证据，以表明该矩系统与基于个体的 E. coli 趋化性模拟器在定量上是一致的。
引用
@article{arxiv.1303.3054,
title = {A pathway-based mean-field model for E. coli chemotaxis: Mathematical derivation and Keller-Segel limit},
author = {Guangwei Si and Min Tang and Xu Yang},
journal= {arXiv preprint arXiv:1303.3054},
year = {2013}
}
备注
21 pages, 3 figures