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秀丽隐杆线虫不同生命阶段的多层PPI网络分析

分子网络 2016-02-29 v1 种群与进化 亚细胞过程

摘要

分子网络充当细胞活动的骨干,为理解生物的发育变化提供了绝佳机会。尽管网络数据通常仅构成静态网络图,构建多层PPI网络可为每个生命阶段特定的发育作用提供线索,并可能揭示这些发育变化的重要性。此处分析的秀丽隐杆线虫(Caenorhabditis elegans)发育生物学模型为理解生物生命阶段期间的进化模式提供了成熟平台。在本研究中,广泛研究的网络属性对所有PPI层展现出总体相似的统计特征。此外,度-度相关性和谱性质的分析不仅揭示了各PPI层中的关键差异,也表明它们之间存在变化的复杂性。线虫生命阶段的PPI层展现出不同于其余PPI层的各种网络属性,表明此阶段细胞多样性和发育转换的特定作用。此处提出的框架为探索和理解生物不同生命阶段发生的发育变化提供了方向。

关键词

引用

@article{arxiv.1602.08314,
  title  = {A multilayer PPI network analysis of different life stages in C. elegans},
  author = {Pramod Shinde and Sarika Jalan},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1602.08314},
  year   = {2016}
}