Celeganser：线虫形态与年龄的自动化分析
计算机视觉与模式识别
2020-05-12 v1
摘要
线虫 Caenorhabditis elegans（C. elegans）作为重要的模式生物广泛应用于各类生物学研究。本文介绍一种用于 C. elegans 图像自动化分析的流程，以研究寿命、健康寿命及衰老的潜在遗传决定因素。我们的系统检测并分割线虫，并在虫体每个像素位置预测体坐标。这些坐标提供个体间稠密对应，以支持有意义的比较分析。我们展示了经预训练以执行体坐标回归的模型可提取丰富特征，用于高精度预测个体线虫年龄。这为未来量化器官生理与生化状态同个体寿命/健康寿命之间关系的研究奠定基础。
引用
@article{arxiv.2005.04884,
title = {Celeganser: Automated Analysis of Nematode Morphology and Age},
author = {Linfeng Wang and Shu Kong and Zachary Pincus and Charless Fowlkes},
journal= {arXiv preprint arXiv:2005.04884},
year = {2020}
}
备注
Computer Vision for Microscopy Image Analysis (CVMI) 2020