秀丽隐杆线虫突变体的自动化行为指纹识别
定量方法
2013-01-08 v1 生物物理
摘要
遗传学、基因组学和成像技术的快速进展，以前所未有的细节和广度揭示了多种模式生物行为的分子和细胞基础。分离行为突变体、克隆并表征突变基因、以及阐明行为表型的分子和神经基础正变得日益常规。相反，反向遗传学方法使得在全基因组序列中直接识别感兴趣基因并产生可用于表型分析的突变体成为可能。在后一种方法中，表型分析构成了主要瓶颈；当涉及将自由行为动物的表型与基因型联系起来时，对行为本身的分析仍然流于表面且耗时。然而，过去十年中许多自动化行为分析的原理验证研究已使该领域处于激动人心发展的边缘，有望开始缩小这一差距。从最广泛的意义上讲，本章的目标是探讨通过仔细观察行为我们可以了解到哪些关于神经功能相关基因的知识。这种方法植根于模式生物遗传学，但也融合了动物行为学、神经科学以及计算机视觉和生物信息学的思想。在介绍秀丽隐杆线虫 (C. elegans) 作为模式生物后，我们将综述导致当前线虫行为表型分析最新水平的研究，并介绍正在转变我们行为遗传学研究方法的当前研究。
引用
@article{arxiv.1301.1017,
title = {Automated behavioural fingerprinting of C. elegans mutants},
author = {André E. X. Brown and William R. Schafer},
journal= {arXiv preprint arXiv:1301.1017},
year = {2013}
}
备注
Accepted for publication in "Linking Phenotypes and Genotypes - How to Infer Genetic Architecture from Perturbation Studies", edited by Florian Markowetz (Cambridge) and Michael Boutros (Heidelberg), Cambridge University Press. 28 pages, 6 figures