复杂生物网络的结构与动力学研究

Areejit Samal

复杂生物网络的结构与动力学研究

分子网络 2008-12-31 v1

作者: Areejit Samal

摘要

在本论文中，我们利用图论、计算生物学和动力系统的工具，研究了某些生物网络的大尺度结构和系统级动力学。我们研究了大肠杆菌(Escherichia coli)、酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)和金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)三种生物体内大规模代谢网络的结构与动力学。我们还研究了控制大肠杆菌代谢的大规模遗传网络的动力学。我们试图根据这些网络的底层结构来解释其观察到的系统级动力学特性。我们对这些大规模生物网络系统级动力学的研究，为其功能提供了与纯结构研究不同的视角。我们的研究还对这些大规模生物网络的鲁棒性、脆弱性和模块化等特征提出了一些新的见解。我们还揭示了细胞内不同网络（如代谢网络和遗传网络）之间如何相互关联。

关键词

生物网络代谢网络遗传网络图论计算生物学动力系统鲁棒性模块化

引用

@article{arxiv.0812.5094,
  title  = {Study of the structure and dynamics of complex biological networks},
  author = {Areejit Samal},
  journal= {arXiv preprint arXiv:0812.5094},
  year   = {2008}
}

备注

165 Pages, PhD Thesis, University of Delhi, India

复杂生物网络的结构与动力学研究

摘要

关键词

引用

备注

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