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代谢网络中模块化的层次组织

软凝聚态物质 2009-11-07 v1 统计力学 q-bio

摘要

空间或化学隔离的功能模块由多个细胞组成器件并承担离散功能,被视为细胞组织的基本构件,但其在高度集成的生化网络中的存在缺乏定量支持。本研究表明,43 种不同生物体的代谢网络被组织成许多小型高度连通的拓扑模块,这些模块以层次方式组合成更大的、较不连通的单元,其数量和聚类程度遵循幂律分布。在大肠杆菌中,发现的层次模块化与已知的代谢功能高度重叠。该识别出的网络架构可能是系统水平细胞组织的通用特征。

关键词

引用

@article{arxiv.cond-mat/0209244,
  title  = {Hierarchical organization of modularity in metabolic networks},
  author = {E. Ravasz and A. L. Somera and D. A. Mongru and Z. N. Oltvai and A. -L. Barabasi},
  journal= {arXiv preprint arXiv:cond-mat/0209244},
  year   = {2009}
}