蛋白质设计问题的确定性方法
软凝聚态物质
2007-05-23 v1 q-bio
摘要
我们基于一个模型考虑了蛋白质设计问题，该模型中氨基酸残基之间的接触能使用Miyazawa-Jernigan矩阵进行唯象拟合。由于接触能函数的简单形式，我们找到了一个解析方案，该方案允许我们为固定的氨基酸残基组成和目标结构设计能量稳定的序列。将理论获得的序列与真实蛋白质进行比较，获得了良好的一致性。最后，我们讨论了用于拟合接触能的程序中的差异对我们理论预测的影响。
引用
@article{arxiv.cond-mat/9803323,
title = {A Deterministic Approach to the Protein Design Problem},
author = {Maksim Skorobogatiy and Hong Guo and Martin J. Zuckermann},
journal= {arXiv preprint arXiv:cond-mat/9803323},
year = {2007}
}
备注
15 pages, 4 figures