蛋白质设计与相互作用势提取的变分方法
统计力学
2009-10-31 v1 软凝聚态物质
生物大分子
摘要
我们提出并讨论了一种解决蛋白质折叠正问题和逆问题的新方法。所提出的策略基于一种变分方法,该方法可以同时提取氨基酸相互作用和氨基酸序列的低温自由能。这种基于知识的技术简单且易于实现,即使对于现实的非格点蛋白质也是如此,因为它不需要类似线程化的过程。其有效性在格点模型的背景下通过各种严格的检验进行了评估。
引用
@article{arxiv.cond-mat/9804054,
title = {Variational approach to protein design and extraction of interaction potentials},
author = {Flavio Seno and Cristian Micheletti and Amos Maritan and Jayanth R. Banavar},
journal= {arXiv preprint arXiv:cond-mat/9804054},
year = {2009}
}
备注
5 pages, 3 figures