正则与广义质量作用系统稳态对应的一种计算方法
数值分析
2014-07-22 v2 化学物理
分子网络
摘要
最近人们观察到,源自许多生化反应网络模型的质量作用系统的动力学性质,可以通过考虑相关广义质量作用系统的相应性质来推导。被称为网络翻译的对应过程已被证明在表征系统稳态方面非常有用。在本文中,我们进一步发展了网络翻译理论,特别关注一类称为非正常翻译的翻译子类。对于这些翻译,我们推导了关于翻译后网络拓扑的条件,这些条件足以保证原始系统与翻译后系统具有相同的稳态。随后,我们提出了一种混合整数线性规划(MILP)算法,该算法能够确定质量作用系统是否可以通过网络翻译过程对应到广义系统。
引用
@article{arxiv.1407.4796,
title = {A Computational Approach to Steady State Correspondence of Regular and Generalized Mass Action Systems},
author = {Matthew D. Johnston},
journal= {arXiv preprint arXiv:1407.4796},
year = {2014}
}
备注
41 pages, 4 figures