分子构象空间的中心划分。IV. 从元胞图中提取信息
计算物理
2008-12-14 v3 化学物理
摘要
在先前的工作 [physics/0204035, physics/0404052, physics/0509126] 中描述了一种将分子系统的 维构象空间划分为若干离散元胞的方法，该划分允许从分子动力学轨迹中采样的数据构建一种组合结构：元胞图，其编码了系统在热漫游中访问的构象空间中的元胞集合。在此我们概述了一组从该结构中提取有用信息的程序：1) 系统在构象空间中所占体积中的有趣区域可由多面锥界定，其面由分子坐标之间的一组关系经验确定；2) 还表明该锥可分解为一组层次化的更小锥；3) 锥中的元胞集合可由简单的组合序列编码。
引用
@article{arxiv.physics/0611108,
title = {A Central Partition of Molecular Conformational Space. IV. Extracting information from the graph of cells},
author = {Jacques Gabarro-Arpa},
journal= {arXiv preprint arXiv:physics/0611108},
year = {2008}
}
备注
added an intrduction and references