分子构象空间中计算能量的距离组合枚举
计算物理
2009-12-09 v1 化学物理
摘要
先前的工作表明，蛋白质三维构象可以编码为称为优势划分序列(DPS)的离散序列，该序列将分子构象空间线性划分为具有相同DPS的分子构象区域。本文描述了在立方格点上构建与给定DPS兼容的三维构象集合的程序。此外，该集合可以结构化为一个图，在此基础上可应用组合算法来计算单元中构象的平均能量。
引用
@article{arxiv.0912.1375,
title = {A Combinatorial Enumeration of Distances for Calculating Energy in Molecular Conformational Space},
author = {Jacques Gabarro-Arpa},
journal= {arXiv preprint arXiv:0912.1375},
year = {2009}
}