分子构象空间的中心划分。V. 三维划分序列的超图
计算物理
2011-05-17 v2 化学物理
摘要
在先前的工作中,描述了一种将分子系统的 维构象空间划分为若干离散单元的过程,该划分允许从分子动力学轨迹中采样的数据构建一个组合结构:单元图或G,编码了系统在热游走中访问的构象空间中的单元集合。然而,G中的信息被编码在大量必须被聚合的片段中。我们在此描述算法过程:1)将来自G的信息聚合到一个超图中,允许枚举构象空间中的相关单元;2)将数据转换为非常紧凑的格式。
引用
@article{arxiv.0812.2844,
title = {A Central Partition of Molecular Conformational Space. V. The Hypergraph of 3D Partition Sequences},
author = {Jacques Gabarro-Arpa},
journal= {arXiv preprint arXiv:0812.2844},
year = {2011}
}