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获取晶格聚合物与蛋白质低温热力学的通用方法

软凝聚态物质 2015-03-17 v1 生物大分子

摘要

我们展示了 Wang-Landau 采样与合适的蒙特卡洛试探移动相结合,为疏水-极性(HP)蛋白质模型以及均聚物的相互作用自回避行走(ISAW)模型提供了一种用于基态搜索和态密度确定的强有力方法。我们获得了具有 >100>100 个单体的 HP 序列以及长达 >500>500 个单体的 ISAW 的热力学量的准确估计。我们的过程具有内在的简洁性,并克服了更定制化方法固有的局限性,使其对广泛的蛋白质和聚合物模型具有吸引力。

关键词

引用

@article{arxiv.1503.04433,
  title  = {Versatile approach to access the low temperature thermodynamics of lattice polymers and proteins},
  author = {Thomas Wüst and David P. Landau},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1503.04433},
  year   = {2015}
}