利用 Wang-Landau 抽样揭示简单格点模型聚合物与蛋白质的优美复杂性
软凝聚态物质
2013-01-16 v1 统计力学
生物物理
计算物理
生物大分子
摘要
我们描述了一类同聚物的“骨架”模型，随着温度降低，这些同聚物在自由空间中发生线团-球体塌缩，或在被吸引性基底捕获时折叠为其天然态或变性态。随后我们展示了，通过使用适当选择的试探移动集，Wang-Landau Monte Carlo 抽样可用于研究这些极具趣味性的简单系统的粗糙自由能景观与基态（天然态），从而阐明其热力学复杂性。
引用
@article{arxiv.1301.3466,
title = {Unraveling the beautiful complexity of simple lattice model polymers and proteins using Wang-Landau sampling},
author = {Thomas Wüst and Ying Wai Li and David P. Landau},
journal= {arXiv preprint arXiv:1301.3466},
year = {2013}
}
备注
22 pages, 6 figures