用于蛋白质折叠的多自重叠系综：基态搜索与热力学
软凝聚态物质
2009-10-31 v1 统计力学
q-bio
摘要
作者近期发展的多自重叠系综（MSOE）蒙特卡洛方法被用于研究 HP 晶格蛋白模型的长链。MSOE 成功找到了此前报道的二维和三维中链长 序列的最低能态。而且，MSOE 实现了 N=100 情形下迄今发现的最低能态。这些序列的有限温度性质也由 MSOE 进行了研究。在天然态与无规线团态之间观察到两次连续转变。热力学分析表明基态简并度与 HP 模型中的转变级次相关。
引用
@article{arxiv.cond-mat/9903003,
title = {Multi-Self-Overlap Ensemble for protein folding: ground state search and thermodynamics},
author = {George Chikenji and Macoto Kikuchi and Yukito Iba},
journal= {arXiv preprint arXiv:cond-mat/9903003},
year = {2009}
}
备注
4 pages, 4 figures